1948年10月，蒋介石召集亲信秘密会议，商讨一旦战败，国民党的党政中心迁往何处。有人建议模仿抗战时期，迁往大西南。蒋介石的同乡、浙江大学教授张其昀主张撤往台湾。他分析：台湾海峡海阔浪高，可以暂时阻止解放军的追击。台湾物产丰富，有日本人建立的工业基础，交通也很发达，有利于国民党的统治。他的分析很合蒋介石的心意，一个重大决策在蒋的心中酝酿。

1948年12月24日，蒋介石突然下令改组台湾省政府，任命亲信陈诚为台湾省主席。次日任命长子蒋经国为国民党台湾省党部主任。这样，蒋在下野之前已把台湾的党政大权紧紧抓在自己手里。人事安排妥当后，蒋介石开始秘密实施撤退计划。

首先是搬运国民党中央银行的黄金储备。1948年11月，蒋介石密令中央银行总裁俞鸿钧将库存的黄金储备运往台湾。而主管银行的行政院和财政部均不知情。俞鸿钧亲自组织一个机密工作小组，将金银装箱。11月30日夜，上海外滩戒严，工人从外滩的中央银行金库中搬运了774箱，共约200万两黄金，由国民党海军登陆舰“美盛号”护送，12月2日到达台湾的基隆港。台北海关派专车把黄金运走，藏在秘密的地点。接着又将151箱共约57万两黄金和1000箱共约400万银元运到厦门。

第二次秘密运输黄金是1949年1月10日。这一次是更大规模的运输，动用了军舰、民轮和飞机。国民党中央汇报：目前黄金储备，运到台北260万两，厦门90万两，存在美国38万两，上海仅存20万两。此外还有数千万银元也转运到台湾。蒋介石这才定了心。有了黄金，他在台湾的经济基础就有了。此时，蒋看似在溪口老家游山玩水，会晤乡亲，实际上在暗中指挥调度，忙碌不堪。“代总统”李宗仁则被蒙在鼓里，当他得知消息时，国库已空空如也。

《中央日报》〔中央社〕讯报导：“7日下午8时，国民党行政院举行会议，阎锡山、朱家骅、陈立夫、黄少谷、万鸿图、关吉玉、杭立武出席了会议，列席的有何彤、胡庆育、秦德纯、尹静夫、刘绍庭、贾景德、倪炯声、邱昌渭。阎锡山担任会议主席”。会议在沉闷的气氛中宣布开始，大家都没有什么多说的话，只是根据蒋介石的已定意见在这里举举手表示一下“法律”程序而已。

会议在短短的40分钟内即宣布结束，其通过的《决议》除“政府迁设台北”外，还有如下重要内容：

(一)提议并通过西南军政长官张群呈请辞职，应予免职，特派顾祝同兼西南军政长官案。

(二)提议并通过西安绥靖公署即撤销，派胡宗南为西南军政长官公署副长官兼参谋长案。

(三)提议并通过重庆卫戌总司令部即撤销，派杨森为西南军政长官公署副长官兼代川陕甘边区绥靖公署主任案。

(四)提议并通过派王缵绪为西南第一路游击总司令，唐式遵为西南游击第二路总司令案。

(五)提议并通过成立成都省会防卫总司令部，派盛文为总司令，余锦源、严啸虎为副总司令，严啸虎仍兼成都警备司令案。

(六)提议并通过西昌警备司令部改为西昌警备总司令部，拟任贺国光为总司令案。

会议的这些决议，特别是国民党政府迁台的消息当晚就在城中迅速传开，在国民党所有人员中引起了巨大震动，一时瓦釜雷鸣，这些刚一身泥土逃难到此地的国民党大小官员，又在纷纷选择另一片“净土”了。